Magerit es un clúster compuesto por nodos Power7 e Intel Xeon. Esto permite proporcionar la infraestructura más adecuada a cada necesidad de cómputo de alto rendimiento.
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Arquitectura Power7
Arquitectura POWER Tiempo de espera muy alto # Procesadores: 3.920 cores Memoria: 7.840 GB Potencia: 103,50 TFLOPS Rpeak 72,03 TFLOPS Rmax Magerit está compuesto por 245 nodos eServer BladeCenter PS702 cada uno de los cuales dispone de 2 procesadores Power7 de 8 cores a 3'3 GHz (422,4 GFlops) y con 32 GB de RAM. Los nodos están interconectados con una red Infiniband DDR.
Se utiliza un sistema operativo SLES11 SP1 con OpenMPI 1.6.3 sobre Infiniband para paso de mensajes.
El uso principal de estos nodos es computación intensiva de altas prestaciones. Proporcionan la mejor relación de potencia y permiten ejecuciones de miles de procesos en paralelo.
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Arquitectura Intel
Arquitectura Intel Tiempo de espera alto # Procesadores: 656 cores Memoria: 2.624 GB Potencia: 13,64 TFLOPS Rpeak 12,69 TFLOPS Rmax Magerit dispone de 41 nodos con 2 procesadores Intel Xeon E5-2670 de 8 cores a 2.6 GHz (332 GFlops) y con 64 GB de RAM. Los nodos están interconectados con una red Infiniband QDR.
Los nodos utilizan un sistema operativo SLES11 SP3 con OpenMPI 1.6.5 sobre Infiniband para paso de mensajes.
Estos nodos están previstos para cubrir aquellos casos en los que no es posible utilizar la arquitectura POWER.
Toda esta infraestructura de computación tiene acceso al sistema de almacenamiento, permitiendo procesar grandes volúmenes de datos. En el manual de usuario se dispone de una descripción detallada del sistema y su utilización.
El sistema basado en arquitectura Power7 fue, en junio de 2011, el supercomputador más potente de España. En la actualidad sigue siendo uno de los supercomputadores de propósito general más potentes de España.
Software
Tanto para la arquitectura Power como Intel se dispone de una amplia plataforma software, que día a día se amplía. Si necesita un software que no aparece en la relación adjunta, solicítelo al Centro de Atención a Usuarios (CAU) y se analizará la viabilidad de su implantación.
Dentro del catálogo existe software que necesita licencia o es un producto comercializado. Todo grupo de investigación que necesite acceder a este tipo de software o requiera se instale uno nuevo, deberá acreditar que dispone de licencia que le autoriza para su instalación en las infraestructuras del CeSViMa.
ABINIT
POWER
6.12.2-gnu64-4.7
6.12.2-gnu64-4.4
ABYSS
POWER
1.3.3-gnu64-4.4
1.3.3-gnu64-4.3
1.3.2-gnu64-4.4
AMBER
POWER
amber14.9-gnu64-4.7
amber14-gnu64-4.7
amber12-gnu64-4.7
amber11-gnu64-4.4
amber11-gnu64-4.3
amber10-gnu64-4.4
Intel
amber14.9
ANSYS
Intel
16.2
ARMADILLO
Intel
7.400.2
ARPACK
POWER
2.1
ATLAS
POWER
3.10.2-gnu64-4.3
3.10.1-gnu64-4.7
3.10.1-gnu64-4.3
3.8.4-gnu64-4.3
AUTODOCK
POWER
4.2.6-gnu64-4.7
4.2.6-gnu64-4.7
4.2.5.1-gnu64-4.7
4.2.5.1-gnu64-4.4
AUTODOCK-VINA
POWER
1.1.2-2-gnu64-4.4
1.1.2-2-gnu64-4.3
BLACS
POWER
1.1-gnu64-4.7
1.1-gn64-4.4
Intel
1.1
BLAS
POWER
lib
lib
Intel
lib
BLAST
POWER
2.2.29-gnu64-4.7
2.2.25-gnu64-4.4
ncbi-blast-2.2.29-gnu64-4.7
BOOST
POWER
1_58_0-gnu64-4.7
1_49_0-gnu64-4.7
1_49_0-gnu64-4.3
1_49_0-gnu64-4.3
1_47_0-gnu64-4.3
Intel
1_58_0
1_49_0
CAFFE
Intel
2016.12.02-20.05.45
CFITSIO
POWER
3.370-gnu64-4.7
3.370-gnu64-4.7
cfitsio-3.300-gnu64-4.3
CGAL
POWER
4.8.1-gnu47-64
Intel
4.8.1-gnu64-4.7
CINT
Intel
5.18.00-gnu64-4.7
CLAPACK
POWER
3.2.1-gnu64-4.4
CLHEP
POWER
2.2.0.3-gnu64-4.7
2.2.0.3-gnu64-4.7
2.1.2.5-gnu64-4.3
2.1.1.0-gnu64-4.3
Intel
2.1.2.5-gnu64-4.7
2.1.1.0-gnu64-4.7
COMSOL
Intel
comsol53
comsol43
CP2K
POWER
2014-09-19-gnu64-4.7
2012-03-02-gnu64-4.4
cp2k-4.1-gnu64-4.7
cp2k-2.5.1-gnu64-4.7
cp2k-2.5.1-gnu64-4.4
cp2k-2.1.397-gnu64-4.4
CPLEX
Intel
CPLEX_Enterprise_Server1261
CPMD
POWER
3.17.1-gnu64-4.3
3.17.1-gnu64-4.3
3.15.1-gnu64-4.4
3.15.1-gnu64-4.3
CRYSTAL
POWER
14
09-gnu64-4.4
09-gnu64-4.3
CUDNN
Intel
6.5-v2
6.5-v1
DLR-TAU
POWER
2013.1-gnu64-4.4
2013.1-gnu64-4.3
2011.1-gnu64-4.4
Intel
2013.1
ELPA
POWER
2016.05.002
FFTW
POWER
3.3.7-gnu64-4.9
3.3.4-gnu64-4.7
3.3.4-gnu64-4.4
3.3.3-gnu64-4.4
3.3-gnu64-4.4
2.1.5-gnu64-4.4
Intel
3.3.4
FHI-AIMS
POWER
160328_2-gnu64-4.8
081213-gnu64-4.8
081213-gnu64-4.7
081213-gnu64-4.7
FREESURFER
Intel
5.3.0
FSL
Intel
fsl-5.0.8-gnu64-4.3
GA
POWER
5.1-gnu64-4.4
GADGET2
POWER
2.0.7-gnu64-4.4
GAMESS
POWER
gamess-MAY-2013
Intel
gamess-MAY-2013
GAMS
Intel
gams24.2_linux_x64_64_sfx
GATE
Intel
gate_v6.2-gnu64-4.7
GDAL
POWER
1.9.0-gnu64-4.4
GEANT
Intel
geant4.9.5.p01-gnu64-4.7
GOTHIC
Intel
8.2
8.1
GOTOBLAS2
POWER
1.13-gnu64-4.4
GROMACS
POWER
2016.5-DOUBLE-gnu64-4.9
2016.4-DOUBLE-gnu64-4.9
5.0.4-gnu64-4.7
5.0.4-DOUBLE-gnu64-4.7
5.0.4.DOUBLE.PLUMED-2.1.1-gnu64-4.7
5.0.2-gnu64-4.7
5.0.2-DOUBLE-gnu64-4.7
4.6.5-gnu64-4.7
4.6.5-DOUBLE-gnu64-4.7
4.5.5-gnu64-4.4
4.5.5.DOUBLE-gnu64-4.4
4.5.5.PLUMED-gnu64-4.4
4.5.5.DOUBLE.PLUMED-gnu64-4.7
4.5.5.DOUBLE.PLUMED-gnu64-4.4
GSL
POWER
1.16-gnu64-4.4
1.15-gnu64-4.4
1.14-gnu64-4.4
Intel
1.16-gnu64-4.7
1.15-gnu64-4.7
HDF5
POWER
1.10.1-gnu64-4.7
1.8.13-gnu64-4.7
1.8.13-gnu64-4.7
1.8.13-gnu64-4.7-API-V16
1.8.13-gnu64-4.7-API-V16
1.8.6-gnu64-4.4
1.8.6-gnu64-4.4-API-V16
Intel
1.8.13-gnu64-4.7
1.8.13-gnu64-4.7-API-V16
HEALPIX
POWER
Healpix_3.11-gnu64-4.7
Healpix_2.20a-gnu64-4.4
HSL
Intel
ma57
HWLOC
POWER
hwloc-1.5.1
hwloc-1.5.1-kernel-3.0.13
Intel
svn-5817-gnu64-4.7
hwloc-1.9
HYPRE
Intel
2.11.2
2.10.0b
INTERPROSCAN
Intel
interproscan-5-44.0
interproscan-5.2-45.0
ITK
Intel
4.7.2-gcc64-4.3
4.6.0-gcc64-4.3
LAMMPS
POWER
lammps-28Jun14
lammps-28Jun14
lammps-24Apr13
lammps-17Nov16
lammps-9Dec14
lammps-5Mar12
lammps-1.9.9
lammps-1Feb14
LAPACK
POWER
3.5.0-gnu64-4.7
3.5.0-gnu64-4.4
3.4.2-gnu64-4.7
3.4.2-gnu64-4.4
3.3.1-gnu64-4.4
3.3.1-xlf-13.1
Intel
3.5.0
3.3.1
LIBINT
POWER
2.0.3-gnu64-4.7
2.0.3-gnu64-4.7
1.1.5-gnu64-4.7
1.1.5-gnu64-4.7
1.1.4-gnu64-4.4
LIBLINEAR
Intel
1.96
LIBSVM
Intel
3.20
LIGGGHTS
Intel
3.3.0
METIS
POWER
METIS-5.1.0
PARMETIS-4.0.3
Intel
METIS-5.1.0
METIS-4.0.3
PARMETIS-4.0.3
MUMPS
POWER
4.10.0-gnu64-4.4
Intel
5.0.0
4.10.0
NAMD
POWER
2.12-gnu64-4.7
2.10b1-gnu64-4.3
2.10b1-gnu64-4.3
2.10-gnu64-4.3
2.9b3-gnu64-4.4
2.9-gnu64-4.4
2.9-gnu64-4.4
2.9-PLUMED-2.1.1-gnu64-4.4
2.8-gnu64-4.4
2.8-PLUMED-1.3-gnu64-4.4
NEKTAR
Intel
4.4.0
NEKTAR++
Intel
4.2.0+MKL
4.0.1
4.0.1+MKL
3.3.0+MKL
NETCDF
POWER
4.3.2-gnu64-4.7
4.3.2-gnu64-4.7
4.1.3-gnu64-4.7
4.1.3-gnu64-4.4
Intel
4.3.2
NWCHEM
POWER
6.8-release
6.3.revision2-src.2013-10-17
6.1
OCTAVE
POWER
3.8.1-gnu64-4.4-GraphicsMagick
3.6.2-gnu64-4.4-ImageMagick
3.6.2-gnu64-4.4-GraphicsMagick
3.6.2-gnu64-4.3
3.6.2-gnu64-4.3-ImageMagick
3.6.2-gnu64-4.3-GraphicsMagick
Intel
3.8.1-gnu64-4.7-GraphicsMagick
3.8.1-gnu64-4.3
3.8.1-gnu64-4.3-GraphicsMagick
3.6.4-gnu64-4.7
OF
POWER
3.0+
3.0+OLD
OPENCV
Intel
3.1.0-QT
3.1.0-QT-CONTRIB
2.4.10
2.4.10-QT
OPENFOAM
POWER
5.0
4.1
4.0
3.0.1
3.0.1-MOD
3.0+
2.4.0
2.3.1
2.2.2
dev
Intel
5.0
4.0
3.0.1
2.3.1
2.2.2
OPENFOAM-EXTENDED
POWER
3.1
Intel
3.2
3.1
OPENGV
Intel
2014.11.19-22.18.53
OPENMX
POWER
3.7.8-gnu64-4.7
3.7.8-gnu64-4.7
3.7.8-gnu64-4.4
3.6.1-gnu64-4.4
3.5.1-gnu64-4.4
Intel
3.7.8-intel64
OpenBUGS
Intel
3.2.3-gnu64-4.3
3.2.2-gnu64-4.3
PARAVIEW
Intel
4.4.0
PETSC
POWER
3.5.2-gnu64-4.7
3.5.2-gnu64-4.7
3.3-p6-gnu64-4.7
3.3-p6-gnu64-4.4
3.3-p6-gnu64-4.3
3.0.0-p12-gnu64-4.7
3.0.0-p12-gnu64-4.7
2.3.3-p16-gnu64-4.3
2.3.3-p15-gnu64-4.4
Intel
3.6.3
3.6.0
3.5.2
PFFT
POWER
1.0.7-gnu64-4.7
1.0.7-gnu64-4.3
PLUMED
POWER
2.1.1-gnu64-4.7
2.1.0-gnu64-4.7
2.1.0-gnu64-4.7
2.0.4-gnu64-4.7
2.0.4-gnu64-4.7
PNFFT
POWER
1.0.6-gnu64-4.7
1.0.6-gnu64-4.3
PYFOAM
POWER
0.6.5
Quantum-ESPRESSO
POWER
6.1-gnu64-4.7
5.1-gnu64-4.7
5.1-gnu64-4.7
5.0.3-gnu64-4.7
5.0.3-gnu64-4.4
5.0.2-gnu64-4.4
R-project
POWER
3.2.5-gnu64-4.3
3.1.1-gnu64-4.3
3.0.2-gnu64-4.4
2.15.3-gnu64-4.4
2.14.1-gnu64-4.4
Intel
3.2.5-gnu64-4.3
3.1.1-gnu64-4.7
3.0.2-gnu64-4.7
3.0.2-gnu64-4.3
ROOT
Intel
5.34-gnu64-4.7
SCALAPACK
POWER
2.0.2-gnu64-4.7
2.0.2-gnu64-4.4
2.0.1-gnu64-4.4
2.0.1-xlf-13.1
Intel
2.0.2
SCOTCH
POWER
6.0.3-gnu64-4.4
6.0.0-gnu64-4.4
6.0.0_esmumps-gnu64-4.4
Intel
6.0.3-x86-64
6.0.0-x86-64
6.0.0_esmumps-x86-64
SIESTA
POWER
4.0-gnu64-4.7
3.2-pl-5-gnu64-4.7
3.2-gnu64-4.7
3.1-gnu64-4.4
LDAU-308-gnu64-4.7
Intel
3.2-pl-5
SILVACO
Intel
2012
SLEPC
Intel
3.6.2
3.6.0
3.5.3
SMARTSPICE
Intel
4.18.16.R
SPARSEKIT
POWER
sparsekit
SPGLIB
POWER
1.9.9-gnu64-4.7
1.7.3-PRE-gnu64-4.7
0.7.1-gnu64-4.4
SPM
Intel
spm12
STARCCM
Intel
13.02.011
12.02.011-R8
12.02.010-R8
11.04.012
11.02.010_R8
11.02.009
10.04.009
10.02.012
9.06.009
9.02.007
T-COFFEE
POWER
11.00.8cbe486
TABIX
POWER
0.2.6
TAU-PS
POWER
2.22.2-gnu64-4.4
THEANO
Intel
0.8.2
TORCH
Intel
2015.05.05-18.17.14
TRICUBIC
POWER
1.0-gnu64-4.4
VASP
POWER
5.4.4
5.4.4-gnu64-4.4
5.4.4-MFM2-gnu64-4.4
5.4.1-gnu64-4.3
5.3.5-gnu64-4.7
5.3.5-gnu64-4.4
5.3.5-MFM2-gnu64-4.4
5.3.5-MN-VFM_2017-A-gnu64-4.4
5.3.3-29ENE2013-gnu64-4.4
5.3.2-gnu64-4.4
5.2.12-11NOV2011-gnu64-4.4
5.2.12-gnu64-4.4
4.6.28-gnu64-4-4
VLFEAT
Intel
0.9.20
VORO++
POWER
0.4.6-gnu64-4.7
Intel
0.4.6-gnu64-4.7
WANNIER90
POWER
2.0.1-gnu64-4.4
1.2-gnu64-4.4
WRF
POWER
3.7
XFLOW
Intel
2015
2014
v97.09