| Procesadores | 2.744,0 | |
| Memoria | 5.488,0 | GB |
| Potencia | 15.955,2 | GFLOPS |
Magerit es un clúster formado por 1204 nodos de cómputo, de los que 1036 son BladeCenter JS20 y 168 son BladeCenter JS21, lo que suponen 2.744 CPUs y 5.488GB de RAM. Todos los nodos operan de manera independiente y con la misma configuración software.
Para poder ejecutar en el supercomputador, es necesario solicitar la creación de cuentas en el mismo mediante los correspondientes formularios de solicitud de proyectos y cuentas. Asimismo, está disponible la Guía de usuario del supercomputador Magerit y las plantillas de envío de trabajos.
Están encendidos y disponen de conexión el 100'00% de los nodos de login.
| Nodo E/S: | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Disponibilidad |  | | | | | | | |
| Conectividad | | | | | | | | |
Debido a sus dimensiones, el sistema está configurado para procesar paquetes de trabajos en modo batch. Para ello utiliza el gestor de colas SLURM/Moab que planifica los distintos trabajos con el doble objetivo de maximizar el uso de la potencia del computador y procesar los trabajos de los distintos usuarios de la forma más rápida posible. En todo momento es posible consultar el estado de Magerit en tiempo real (actualizado cada cinco minutos).
| Fecha / Hora | Estado | Trabajos | Ejecución | Espera | Retenido | Otro | % Ocup. | % Carga |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Mar 17, 2010 4:08:25 AM | | 57 | 53 | 0 | 4 | 0 | 59'0% | 64'3% |
Magerit está compuesto por 1036 nodos eServer BladeCenter JS20 cada uno de los cuales dispone de 2 procesadores PPC de 2'2 GHz (8.8 GFlops) con 4 GB de RAM, así como 168 nodos eServer BladeCenter JS21 con 4 procesadores PPC 2'3GHz (9.2 GFlops) con 8GB de RAM. Para su interconexión se utiliza una red Myrinet de fibra óptica de altas prestaciones junto con redes auxiliares Gigabit para su control y gestión.
El sistema dispone de una capacidad de almacenamiento local de unos 192 TB, proporcionado por 256 discos de 750 GB, que utiliza un sistema distribuido y tolerante a fallos (GPFS).
La conexión exterior se realiza a través de RedIRIS mediante enlaces de 1Gb y 10 Gb. Está prevista la actualización de esta conexión según lo aconseje la demanda.
Todos los nodos tienen instalado un sistema operativo SLES10SP2 (Kernel 2.6.16). Además de todo el entorno de trabajo estándar de un sistema Linux, se dispone de las siguientes herramientas y librerías de cálculo científico:
| Aplicación | Versiones | Comentarios |
|---|---|---|
| ABINIT | 4.4.4, 4.6.5, 5.3.3, 5.3.4, 5.4.2, 5.4.4, 5.5.2, 5.6.4, 5.7.3, 5.8.4 | |
| AMBER | 9 | Necesita licencia |
| ATLAS | 3.6 | |
| BLAS | 1.0.0 | |
| BLAST | 1.4, 2.0, 2.3 | |
| BLITZ++ | 0.9 | |
| BLT | 2.4 | |
| CHARMM | c34b1 | Necesita licencia |
| CHARMM++ | 6.1.2 | |
| CMAKE | 2.4.7 | |
| CP2K | 2007.10.01, 2008.01.14, 2008.04.25, 2008.11.27, 2009.01.29 | |
| CPMD | 3.9.1, 3.11.1 | |
| CRYSTAL | 1.0.2 | Necesita licencia |
| DL_POLY | 2.19, 2.19a | |
| DP | 4.5.3, 4.6.2 | |
| FFTW | 2.1.5, 3.0.1, 3.1.1, 3.1.2, 3.2 | |
| gFTP (FTPS) | 2.0.18 | |
| GAMESS | 2005-10-20, 2006-03-15 | |
| GCC, GCC-C++ | 3.3.3, 4.0.1, 4.1.2, 4.2.3 | |
| GMP | 4.2.2 | |
| GMSH | 2.2.4 | |
| GRACE | 5.1.22 | |
| GRID-Superscalar | - | |
| GROMACS | 3.2.1, 3.3, 3.3.1, 4.0, 4.0.2 | |
| GSL | 1.9 | |
| HDF5 | 1.4.4, 1.6.5, 1.6.8, 1.8.0-alpha5, 1.8.2 | |
| IBM ESSL | 1.2 | System |
| IBM XL C/C++ | 8.0 | System |
| IBM XL Fortran | 10.1 | System |
| LAMMPS | 3Jun05, 12Apr06, 22Jan08, 11Oct08, 27Mar09 | |
| LAPACK | 3.0 | |
| LIBINT | 1.1.4 | |
| MATPLOTLIB | 0.98.3 | |
| MCNPX | V26D, V27A | |
| METIS | 4.0 | |
| MPE | 1.0.6 | |
| MPFR | 2.3.0 | |
| MPIBZIP2 | 0.6 | |
| NAMD | 2.5, 2.6 | |
| NETCDF | 3.6.0, 3.6.1, 3.6.2 | |
| NUMPY | 1.1.1 | |
| NWChem | 4.7, 5.0, 5.1 | |
| OCTAVE | 3.0.0 | |
| PERL | 5.8.8 | |
| PYTHON | 2.5.1 | |
| QUANTUM ESPRESSO | 3.1.1, 4.0, 4.0.1, 4.0.5 | |
| R | 2.0.1, 2.5.0, 2.6.2, 2.8.1, 2.9.2 | |
| SCALAPACK | 1.7 | |
| SCIPY | 0.6.0 | |
| SIESTA | 1.3 ,1.4.18, 2.0, 3.0-beta | Necesita licencia |
| SILO | 4.6.2 | |
| SPARSKIT | 2 | |
| Sockets-GM | 1.3+1 | |
| TCL/TK | 8.4 | |
| VALGRIND | 3.3.1 | |
| VASP | 4.6.28, 5.2 | Necesita licencia |
| VMD | 1.8.5 | |
| WRF | 2.1.2 | |
Centro de Supercomputación y Visualización de Madrid.
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